Un uomo viene ritrovato per caso e tratto prontamente in salvo al largo delle coste mediterranee da un peschereccio italiano. In evidente stato d'amnesia, non ricorda il suo nome, il suo passato e il motivo per cui si ritrova con un paio di pallottole nella schiena e un numero di un conto corrente svizzero racchiuso in una capsula sottocutanea. Scoprirà di essere tal Jason Bourne, pedina braccata dalla CIA e isolata dal mondo che può fare affidamento solo sul suo istinto e sull'aiuto della giovane Marie per poter ritrovare la propria identità perduta...